国内的汽车厂家还未在空调系统中使用无刷直流电机的原因主要有：

1)无刷直流电机的工作需要外加驱动控制器，系统成本高，昂贵的电机和驱动器限制了其使用。

2)集成化程度不高，驱动控制电路工作的稳定性对电机的运行有很大影响，而且国内暂时还没有可靠的无刷直流电机控制驱动器集成化产品供货商。

3)控制技术上的不成熟，其主要有：①转子位置信号检测存在误差，再加上电机本身齿槽的原因，导致电机出现转矩脉动；②无刷直流电机的启动较困难，在不同应用场合，如何让电机平滑、可靠的启动是一个技术难题；③在震动较大或负载突变时，往往容易导致电机失步，无法正常运行等。这些问题就限制了其在某些场合的使用。

综上所述，无刷直流电机的应用还存在一些缺陷，但由于它具有的广阔应用前景，国内外诸多学者在其控制技术上做了大量的研究，同时也取得了很大的成果，这就为无刷直流电机的进一步发展奠定了基础。